JCEG ID | JCEG217 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Name | gly-3 WormBase NCBI Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human Ortholog |
GGDB:GALNT1 OrthoList : GALNT1 GALNT13 (Ensembl Compara)
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Family Name | ppGalNAcT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Locus Tag | ZK688.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNAi phenotype |
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Sequence Features | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | CDS |
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Protein |
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References |
Hagen FK, Nehrke K J. Biol. Chem. (1998) 273 (14) :8268-77 [PMID : 9525933] cDNA cloning and expression of a family of UDP-N-acetyl-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase sequence homologs from Caenorhabditis elegans. Schwientek T, Bennett EP, Flores C, Thacker J, Hollmann M, Reis CA, Behrens J, Mandel U, Keck B, Schafer MA, Haselmann K, Zubarev R, Roepstorff P, Burchell JM, Taylor-Papadimitriou J, Hollingsworth MA, Clausen H J. Biol. Chem. (2002) 277 (25) :22623-38 [PMID : 11925450] Functional conservation of subfamilies of putative UDP-N-acetylgalactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferases in Drosophila, Caenorhabditis elegans, and mammals. One subfamily composed of l(2)35Aa is essential in Drosophila. Wang H, Spang A, Sullivan MA, Hryhorenko J, Hagen FK Mol. Biol. Cell (2005) 16 (9) :4202-13 [PMID : 15987734] The terminal phase of cytokinesis in the Caenorhabditis elegans early embryo requires protein glycosylation. Berninsone PM WormBook (2006) :1-22 [PMID : 18050430] Carbohydrates and glycosylation. Shaye DD, Greenwald I PLoS ONE (2011) 6 (5) :e20085 [PMID : 21647448] OrthoList: a compendium of C. elegans genes with human orthologs. Bennett EP, Mandel U, Clausen H, Gerken TA, Fritz TA, Tabak LA Glycobiology (2012) 22 (6) :736-56 [PMID : 22183981] Control of mucin-type O-glycosylation: a classification of the polypeptide GalNAc-transferase gene family. |
Functional Descriptions |
gly-3 gly-3 encodes an N-acetylgalactosaminyltransferase that is functional in vitro. |
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Deletion Mutants | gk353 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
In Situ | In Situ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Expression |
Expression
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WBGene00001628 Phenotype Homology_paralog |
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Phenotype | Definition | RNAi / Allele |